En el caso de un déficit de DAO, la histamina endógena o exógena no puede ser degradada con suficiente rapidez y se desarrollan los síntomas característicos de la intolerancia a la histamina (problemas gastrointestinales, migraña, irritaciones de la mucosa nasal y otros síntomas alérgicos)

• Migraña y otras cefaleas vasculares
• Trastornos gastrointestinales: especialmente aquellos asociados al Síndrome del Intestino Irritable, como estreñimiento, diarrea, saciedad, flatulencia o sensación de hinchazón
• Trastornos dermatológicos: como la piel seca, la atopia o la psoriasis
• Alteraciones musculares: como dolores musculares, con frecuencia diagnosticados de fibromialgia
• Fatiga crónica
• En la infancia y adolescencia se ha relacionado con el trastorno de atención e hiperactividad (TDAH).